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tRF&tiRNA测序
tRF&tiRNA测序
tRF&tiRNA Seq
康成生物为您提供一站式tRF&tiRNA测序技术服务,您只需要提供保存完好的组织或细胞标本,康成的技术服务人员就可为您完成全部实验操作。
服务类别:测序/合成总访问:1843
最后更新:2018-11-26半年访问:342
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  tRF&tiRNA 测序

    tRFs和tiRNAs 是tRNA及其前体通过精确调控的加工过程产生的,作为小非编码RNA行使多种生理功能,与诸多生理病理过程相关(图1)。据报道,tRFs&tiRNAs能够以microRNA的方式参与RNA干扰;结合蛋白因子并调节目标mRNA的稳定性;与细胞色素C互作,调控细胞凋亡;改变胚胎转录级联调控,作为父本表观遗传因子介导代谢疾病遗传;多种应激条件下促进应激颗粒的组装。
    tRFs&tiRNAs 的组成和数量高度依赖于具体的细胞类型和病理状况,使得它们成为一类极佳的生物标志物[1]。例如,tRFs&tiRNAs 之间的比例关系能够作为癌症存活期指标和潜在的诊断标志物[2]。同时,相比其他microRNA,tRNA和tRFs&tiRNAs类群广泛富集于各种生物体液中[3-4]。

图1. tRFs&tiRNAs功能及相关疾病

    康成生物tRF&tiRNA测序服务提供从样品到数据的全套解决方案。根据我们tRF&tiRNA测序和表达谱分析中得到的丰富信息,按照tRF&tiRNA:为什么以及如何研究它们?中提供的方法及应用,科研工作者们能够更便捷地推进他们在这个新兴领域的研究工作。

服务特色
•  性能优化的测序方法与严格的质控过程
•  使用Arraystar独家授权的”tRF & tiRNA Analysis System”
      
基于tRNA拓扑结构和统计显著性的精准注释与分类系统
       全面的tRFs&tiRNAs数据库信息
       tRFs&tiRNAs专注的生物信息学与统计学分析
•  额外的miRNA表达和差异分析
•  出版级的数据和图表展示
•  无缝链接tRNA系列服务:tRNA-seq、tRF&tiRNA PCR array和 tRNA PCR array


生物信息学
   
为了更好地了解tRFs及tiRNAs的生物学特征,促进它们在生物标志物方面的应用,tRF&tiRNA-seq提供了丰富的生物信息学分析。额外福利:其他microRNA的表达分析也包含其中!

1.表达及差异表达谱

图2. 表达及差异分析数据表
 
2.详尽的注释信息

图3. 详尽注释的tRF&tiRNA序列、家族、二级结构以及剪切位点
 
3. tRF&tiRNA在4种小RNA类型中的分布

图4. tRF&tiRNA与其他相似尺寸小RNA之间的相对含量关系,在多种组织中,tRF&tiRNA的占较高甚至主要比例,这强烈预示了其重要的生理功能和生物标志物应用潜质。
 

参考文献
 1.Telonis A.G. et al. (2015) "Dissecting tRNA-derived fragment complexities using personalized transcriptomes reveals novel fragment classes and unexpected dependencies." Oncotarget 6(28):24797-822 [PMID: 26325506]
2.Olvedy M. et al. (2016) "A comprehensive repertoire of tRNA-derived fragments in prostate cancer." Oncotarget [PMID: 27015120]
3.Schageman J. et al. (2013) "The complete exosome workflow solution: from isolation to characterization of RNA cargo." Biomed Res Int 2013:253957 [PMID: 24205503]
4.Dhahbi J.M. et al. (2013) "5' tRNA halves are present as abundant complexes in serum, concentrated in blood cells, and modulated by aging and calorie restriction." BMC Genomics 14:298 [PMID: 23638709]

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