English | 中文版 | 手机版 企业登录 | 个人登录 | 邮件订阅
厂商 仪器 试剂 服务 新闻 文章 视频 高级搜索
当前位置 > 不限id多账号送彩金 > 行业资讯 > 新闻 > Eppendorf 微生物组解决方案助力大熊猫肠道菌群研究
Eppendorf 微生物组解决方案助力大熊猫肠道菌群研究
点击次数:1918 发布日期:2019-6-14  来源:本站 本站原创,转载请注明出处
只吃素也有体重200斤的风险?小E探访大熊猫基地,深挖了它的秘密……
 
大熊猫,昵称“滚滚”,因为蠢萌的外表和稀有的属性,成功在全球吸粉无数,成为年薪百万美元、躺着挣钱的“打工第一熊”。
 
▲ 我身价百万(图为四川成都大熊猫基地的娇庆,图片由四川大熊猫基地提供)
 
虽然长相十分蠢萌,看上去没什么攻击性,但人家祖上毕竟是“嚼铁如泥的食铁兽”(有兴趣的可以百度一下哦)。即使经过了进化,现在的滚滚们的饮食习惯早已从肉食主义转变为了素食主义,可是他们的牙齿和消化道还保持有原样,在种属中划分为食肉目、熊科,发怒时的危险性堪比其他熊种。
 
▲ 注意,猛兽出没(图为四川成都大熊猫基地的娇庆,图片由四川大熊猫基地提供)
 
但为何身为一头猛兽,却在进化的过程中放弃了肉食?只钟情于竹子和竹笋?还能吃得圆滚滚?这里面都有些什么奥妙呢?
 
为了揭开滚滚的秘密,小 E 亲自来到了四川省濒危野生动物保护生物学重点实验室,为大家带来了一线情报。
 
 
小 E 采访了大熊猫基地的(熊猫达人)张文平研究员,那么现在就让他来揭开大熊猫只爱竹笋的秘密吧。
 
张文平研究员
成都大熊猫繁育基地、
四川省濒危野生动物保护
生物学重点实验室
 
下文中小 E 缩写为 E,张文平缩写为张,以下为采访节选,戳这里查看访谈全文
 
E:大熊猫是通过摄取竹子中的纤维素获得能量的吗?
张:我们最初研究这个课题的时候,认为竹子中的主要成分——纤维素与木质素是为大熊猫提供能量的主要来源,但是在研究中逐渐发现,大熊猫从出生到亚成年的过程中,体内纤维素的菌群并没有逐渐增加,这说明大熊猫对纤维素的消化降解能力其实非常有限。而其他的如消化半纤维素、淀粉等菌群的丰度却逐渐增加,与这些菌群相关的基因家族的丰度也是递增的。最终得出结论,大熊猫是通过消化竹子中的半纤维素、淀粉等来获取能量的,纤维素可能仅作为辅助,起到改善肠道菌群的作用。
 
 
划重点:
通过对收集的熊猫粪便进行宏基因组分析,张文平研究员和他的团队发现大熊猫的肠道菌群基本没有摄取竹子中纤维的能力,说明大熊猫并不能从纤维素中获取必须的能量。
 
后续的研究显示大熊猫主要通过竹子中的淀粉、半纤维素、果胶等获取能量,他们选择竹子的主要原因是这种食物分布广泛、生长迅速且拥有高含量淀粉。
 
▲ 梦梦麻烦注意一下自己的体重(图为四川成都大熊猫基地的梦梦,图片由四川大熊猫基地提供)
 
从张文平研究员的结果来看,大熊猫钟情于竹子主要是因为:
● 抢竹子的竞争者少,而竹子分布比较广泛,容易获得
● 和其他木本植物相比,竹子的淀粉含量更高
● 竹子不同部位随四季的变化其淀粉含量亦随之变化,大熊猫总是选择取食竹子中淀粉含量高的部位
 
E:之前您说宏基因组研究熊猫的粪便,那么您能说说具体是怎样应用宏基因组的吗?
张:宏基因组它实际上包含了环境中的细菌、真菌、病毒以及其他的微生物的基因组的总和。最开始我们是从粪便或是菌悬液中提取总的 DNA,这个 DNA 它包括各种微生物的 DNA,然后我们采用 16s 建库的方法,挑单克隆看这个克隆是哪个菌,然后我们逐渐发展到采用 454 测序方法,因为它的测序读长比较长,现在我们已经采用 Miseq 的二代测序方法来进行,它的读长比较长,通过拼接可以达到 200bp。
 
 
张:至于为什么选择熊猫的粪便,当然是因为滚滚的“珍贵”与“特殊”,因此对熊猫的研究很多是采用非损伤的样品采集,所以粪便和尿液就成了最好的对象。我们一般会定时监控大熊猫,一旦发现它有粪便产生,马上进行采集,然后尽快送到实验室处理,用 PBS 清洗了以后放到液氮急冻,再转移到超低温冰箱,在 -80° 的环境中长期保存。


 
正如张文平研究员所说的,基于 NGS 技术的方法已被广泛地应用于标记基因研究、宏基因组学和宏转录组学,从不同侧重点和细节研究微生物群落。为了能够广泛且多角度的比较各单体研究,从样本采集和储存到样本制备的 NGS 工作流程的标准化,以及对测序数据的深入了解都是非常重要的。
 
有感于此,Eppendorf 推出了基于旗下经典的 epMotion 全自动移液工作站为核心的微生物组解决方案,为研究人员提供一个标准化的涵盖样本存储、采集、处理等步骤的测序前处理方案点击可查看 Eppendorf 微生物组样品制备解决方案。


 
通过数年累积的样品和科学的分析方法,张文平研究员获得了这个出色的阶段性研究结果,这份研究成果已发表在国际知名的期刊 The ISME Journal 上。
 
今后他将继续在这个领域进行更深入的研究,如肠道中的哪些菌群对大熊猫的健康是有益的、哪些是有害的,为更科学更合理地喂养大熊猫提供理论依据。
 
这个研究结果的幕后故事,刊载在电子杂志《Off the Bench》上,想要阅读全文的 E 粉儿可以戳下方图片查看
 
▲点图片阅读最新 “Off the Bench” 杂志
 
更多内容请关注Eppendorf官方微信:eppendorfchina,或扫面下方二维码:
索取资料
相关公司:艾本德中国有限公司
联系电话:021-3856 0500
E-mail:market.info@eppendorf.cn


网友评论 已有[0]人评论
用户名: 密码: 匿名 快速注册 忘记密码
评论只代表网友观点,不代表本站观点。 请输入验证码: 8795
Copyright(C) 1998-2019 生物器材网 电话:021-64166852;13621656896 E-mail:info@bio-equip.com
博聚网