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“生物信息大数据系列——Python语言应用培训班”通知
点击次数:5278 发布日期:2017-8-1  来源:本站 本站原创,转载请注明出处
各有关单位:
 
生物信息是一门数据科学,需要从业者具备数据收集、管理、处理和分析的能力。在海量的组学数据面前,使用别人开发的软件及图形界面操作往往不能解决工作中的具体问题,往往需要自己进行编程来解决。因而编程即成为一个生物信息工作者的必备技能。本课程就是为生物信息初学者设计的编程研修班。Python语言是至今为止最接近自然语言的编程语言,,中国科学院计算技术研究所烟台分所特别邀请在机器视觉和机器人研发领域的一线专家,举办“生物信息大数据系列——Python语言应用培训班”。
 
主办单位:中国科学院计算技术研究所烟台分所  烟台中科网络技术研究所
承办单位:北京中科云畅应用技术研究院
培训时间地点:2017年8月18日 — 2017年8月22日 烟 台(第一天报道,培训四天)
培训费用:每人3500 元(含报名费、培训费、资料费),食宿可统一安排,费用自理。
报名电话/传真: 010-58032788
报名邮箱:zky_im@vip.126.com
培训方式:1、培训讲座; 2、软件实操  3、问题咨询答疑;
报名办法:请各有关部门统一组织本地区行政、企事业单位报名参加会议,各单位也可直接报名参加。报名回执表请传真至会务处。
 
颁发证书:学员经培训考试合格后可以获得:由中国科学院计算技术研究所烟台分所颁发的培训证书。
注:请学员带电子版白底彩照、身份证复印件一张。请学员自带笔记本电脑。
 
时间
课程
主要内容
 
 
 
 
 
 
 
 
第一天
Linux 和 Windows 下 Python 语言编写和运行方式
1.Python 的安装
2.Python 的运行
3.IPython notebook 的使用
 
 
1.Python 基本语法和数据结构
2.(基于提供的 IPython notebook 同步操作、调试)
3.层级缩进
4.数值的操作
5.字符串的操作
6.列表操作
7.元组操作
8.Range 使用
9.字典操作
 
Python 输入和输出
1.屏幕输入和输出
2.文件输入和输出
 
 
Python 实战练习
1.读写 FASTA 文件
2.读写 FASTQ 文件
3.FASTA 序列格式转换
4.FASTA 序列排序
 
 
 
 
第二天
回顾第一天的知识
1.提问考核昨天讲过的内容
 
 
Python 实战练习
1.FASTQ 序列提取
2.筛选差异基因矩阵
3.转换矩阵格式
4.简化的序列比对程序
 
Python 正则表达式
1.正则表达式讲解
2.re 模块学习
3.字符串匹配实战
 
 
 
第三天
 
Python 模块和函数操作
1.理解 Python 的模块和函数
2.Python 模块安装
3.函数写作讲解
 
Python 函数实战练习
1.第一二天的练习用函数重写,同类功能模块化
 
Python 命令行参数处理
1.理解命令行参数
2.Python 命令行参数的处理
 
 
第四天
 
 Python 命令行参数实战练习
1.整合命令行参数处理到第三天的程序,使得程序可以处理同类问题
1.Python 矩阵处理模块 Pandas 和画图(Python 像 R 一样处理矩阵和画图)
 
1.Pandas 库介绍
2.矩阵的合并、提取
3.矩阵统计分析
4.科学绘图 (直方图、箱线图、饼图、密度图、热图)
 
参考附件:报名回执表.doc
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